ある少女は願った。
「全ての魔女、魔法少女に本当の救済を」
その願いはある少年に託された。いやその願いが少年になった。。
その少年はマミという少女と魔女を倒していた。彼とともに魔女を倒すと魔法少女を倒すと人に戻すことができソウルジェムの濁りを浄化できた。そして彼らに後輩の魔法少女が仲間になった
。まどか、さやか、後からきたほむら、まどかと彼は兄妹だったので他の人と知り合い仲良く。
特に彼とまどか、ほむらはとても仲良くなった。親友といってもいいぐらいに。とても幸せだったろう。
だがインキュベーターによって壊された。彼らが倒した魔女から絶望のエネルギーが出ないことにきずき、その原因が彼であることがわかった。そして彼を封印し他の彼に関する全てをけした。記憶も忘却した。
「必ず戻ってほむら、まどかを救う」
そして悪魔になった少女により封印は弱まっていく。